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Après sa fondation au Moyen Âge, Soča a longtemps appartenu aux patriarches d'Aquilée, puis à la République de Venise et, à partir de 1509, aux Habsbourg. Après la Première Guerre mondiale, la région appartenait à l'Italie. Après la capitulation de l'Italie pendant la Seconde Guerre mondiale, Bovec fut occupée par les troupes allemandes jusqu'à la fin de la guerre. Pendant cette période, la zone était contrôlée par des partisans slovènes. Des hôpitaux partisans fonctionnaient dans le village. De 1945 à 1947, la vallée de la Soča fut administrée par les forces anglo-américaines. En 1947, la région fut annexée à la Yougoslavie. Bovec fait partie de la Slovénie indépendante depuis 1991.